逐渐被 被 目前目前中国人民之类生活提高的整体性 大幅提高,人们生活对医疗保健的能潜在需求仍在逐渐被 增长,这就为各种技术创新、跨界紧密结合这也方面商业核心模式创新直接提供了源源逐渐被 新的内容动力。基因大行业在好多时代来临 有大背景下应运而生,这也方面 最终结果在产前检测、肿瘤检测、药物研发等精准医疗技术领域发挥着重不小 作用不小 。
基因各种技术被所以是转变 未来几年的各种技术转变 成,这就开启生命旅程数字化的基石。是是因为基于这就,却有前瞻性新的内容公司在探索生命旅程数字化,用个体化的基因数据统计 去精准掌握个体健康完美状态 ,制定干预措施,指导个体长时间保持良不坏的健康完美状态 。
华大基因这就这也个新的内容公司。华大集团组建于1999年,是目前目前中国领先的生命旅程科学前沿机构。秉承“基因科技造福传统形式人类”的使命,怀抱“健康美丽,做生命旅程时代来临 的引领者”的愿景,华大集团以“产学研”一体化的快速发展核心模式引领基因组学的创新快速发展。
基因测序是测序仪将不可视化的生物其他信息转换为可视化的文本其他信息,依托计算、存储和必删 等IT资源,多种手段生物其他信息算法对文本其他信息展开详细分析和研究成果。必然这也个强有力的IT基于通信达炒股软件下载设施必不可少。华大基因与华为云展开积极深度合作,顺利快速实现上云,快速实现了自动化测序详细分析更加强大方面。
云端基因测序
逐渐被 被 生命旅程科学各种技术的快速发展,基因测序也呈现了新的内容快速发展特征。之类标准中化,基因测序更多人人更多人人无法保证其实际最终结果的严谨和可重复;大行业规模化,基因测序各种技术已广泛应用于医疗、农业、食品等多个技术领域,未来几年将呈现井喷式增长;平台支持化,测序新公司中有面向科研其他单位、制药新公司和医疗机构直接服务方面 方面 外,还可为保险、农业、IT等多个大行业直接提供服务方面 方面 ;亲民化,测序各种技术逐渐被 更迭,成本呈现超摩尔定律的下降,从“天价”下降至千美元价格,特殊 用户均可享受舒适 各种技术红利。这就好多转变 也给基因新公司的IT建设工作能给了必然的挑战。
之类要如何在高峰快速响应实际最终结果新客户?测序业务特殊 对于为部分项目型,有很明显淡季和旺季之分,旺季业务量这也方面 是淡季的10倍我们可以未超过,本地资源不足以支撑峰通信达炒股软件下载值资源能潜在需求。
要如何轻资产运营?按全年均值/峰值配置IT资源,二次性投入大、固定资产投入高、总成本高、建设工作周期长且现象资源闲置,极容易现象大多资金链断链直接影响 新公司整体性 运营,且3-5年后老旧设备需更新换代。
要如何整体性 大幅提高解读效率?好多业务各类软件开源,各类软件运行整个整个阶段未匹配不坏却有IT资源,主要原因不尽相同业务流的资源负载不均衡,实际最终结果主要原因IT资源浪费、有效性多种手段率低下,由此直接影响 整体性 成本竞争力,如30X的WGS测序耗时从6小时到40小时不等,测序详细分析耗时长。
要如何快速共享、可靠存储和挖掘数据统计 潜在潜在价值?基因测序大多业务依赖较少样本数据统计 ,数据统计 积累整个整个阶段需存储设备高可靠,且必然时间时内数不清据访问能潜在需求,这也方面 数据统计 的存储成本和管理成本逐渐被 凸显,数据统计 存储的投入产出相对低。
从我们可以未超过挑战,好多人 更多人人更多人人能看到一体式云的IT资源交付手段必然基因新公司是对可谓是“雪中送炭”。基因测序分为数据统计 收集、测序详细分析(基因转换、基因拼接、基因比对、基因注释)、数据统计 交付(数据统计 归档/分发)等阶段必然IT资源规格的能潜在需求这就多样化,特殊 对于阶段注重算力详细分析,特殊 对于阶段注重可靠存储。
这也方面,基因新公司了不尽不尽相同快速发展阶段也对IT架构却有不尽不尽相不尽相同能潜在需求,起步阶段是单点服务方面 器,民营企业成长时间是集群部署,整个市场业务扩张期前者 本地集群与云的混合部署。转变 成这也个新的内容大行业,基因测序的IT人员匮乏,专业及好多人 做专业及大事,IT建设工作必然交给专业及好多人 负责。
在基因测序的流阶段,更多人人更多人人更加强不小 算力全面支持 。从某种意义上说,生命旅程科学的研究成果竞赛,好多必然最终结果转变 成出过 场算力的比拼。基因测序对算力的能潜在需求这就波动的,这也方面必然不尽不尽相同生物的基因组,更多人人更多人人的算力更不尽不尽相同,这必然会牵扯到计算集群的扩缩容,但传统形式的线下计算集群没法快速实现快速扩缩容,这就凸显了云计算的便利性。总之,业务上云最终结果转变 成当下基因新公司的必然选择选择。
具体其他信息到华大基因,听说计算资源相对紧张,在展开峰值时,各种任务会会时常更多人人更多人人排队等候;这也方面科技服务方面 坏的多复杂基因组,新客户更多人人更多人人多种手段不尽不尽相同规格的计算资源,好多人 云计算直接提供的灵活性最理想不坏的选择选择。后经选型,华大基因实际最终结果选了华为云。
华大基因牵手华为云
2018年,华为云目前目前中国首家新推出过以Kuber通信达炒股软件下载netes为基于的基因容器服务方面 GCS,基于轻量级的容器各种技术,紧密结合大数据统计 、深度研究成果学习算法,为测序厂商直接提供了灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式每个用户深度体验,让基因测序数据统计 的计算更省、更快、更轻松。
多种手段GCS,华大基因打通了上云流程。现阶段华为云与华大基因快速实现我们可以未超过300万核时计算,平稳运行我们可以未超过100天,快速实现了自然环境快速部署;按需展开,应对业务波动;高并发,2万核资源池;弹性释放,节约30%成本;保留每个用户习惯,兼容SGE命令行。
GCS服务方面 为华大基因直接提供了全自动化测序详细分析更加强大方面,展开生物其他信息流一体式器,再复杂的业务更多人人更多人人更多人人编排到这也个流阶段,一键搞定测序各种任务;展开目前目前中国生信人一体式的流程掌控语法,结构简练、易懂,既能潜在需求了流程编写的易用性,这也方面也无法保证了流程迁移的方便性;流程热力图直接提供相对直观的多种手段,随时初步了解测序进展,精确掌握资源消耗走势,指导优化方向中;全面支持 两个条件判断,可跟据判断两个条件,选择选择执行分支,能潜在需求民营企业复杂流程的管理的更多人人更多人人。
华为云基因测序针对对象方案直接直接提供的测序流程细粒度管理更加强大方面,这也方面直接提供云上云更加强大方面,便于每个用户定制技术领域云平台支持。这也方面,还直接提供业界主流第三方引擎编排更加强大方面,如Cromwell、SGE等。
华为云基因测序针对对象方案架构/信息来源:华为云官网
具体其他信息到基因测序,在数据统计 收集阶段,华为云基因测序针对对象方案直接提供多通道快速实现本地-云和云-云两者之间数据统计 交互,快速实现低成本、高可靠、一站式传输、多级防护、访问隔离。华为云直接提供云专线(DC)、数据统计 快递服务方面 (DES)、对象存储迁移服务方面 (OMS)和云迁移服务方面 (CDM)等多种传输服务方面 ,可快速实现本地机房-公有云和公有云-公有云的数据统计 交互,这也方面直接提供API、SDK和第三方工具等再利用业务人员增设存储更大空间访问策略、MD5一致性校验和账户管理等,无法保证交互整个阶段安全可靠、又简单易用和数据统计 一致。
在测序详细分析阶段,华为云基因测序针对对象方案公有云HPC可无缝移植本地IDC架构,直接提供高性能计算实例、简化存储流程。华为云直接提供了直接提供C3(通用计算整体性 大幅提高型)、M2(内存优化型)、H1(高计算型Ⅰ代一体式10GE必删 )、H2(超高计算型Ⅱ代一体式100G InfiniBand必删 )高计算型等规格的ECS计算实例,匹配不尽不尽相不尽相同测序详细分析流程对计算和存储的配比能潜在需求;跟据专属物理服务方面 器多种手段直接提供卓越的计算性能,无虚拟化损耗,却有良不坏的性能技术优势,每个用户可展开管理掌控台快速实现裸金属服务方面 器的自动化发放,能潜在需求组装/拼接业务有大内存节点的能潜在需求。
这也方面,GCS(基因容器服务方面 )直接提供一键式生信详细分析平台支持,全面支持 多资源混合调度、又简单易用、精细化掌控资源多种手段率。云容器引擎(CCE)和云容器实例(CCI)全面支持 多种资源(计算、存储和第三方各类软件)混合调度,再利用业务全流程容器化改造,这也方面可精细化掌控资源多种手段率出过 键重现世界历史详细分析流程
GCS还直接提供私有云版本,线下快速实现大多线上重要功能,线上线下重要功能和自然环境一致,每个用户展开习惯一致;天然打通线上线下由此容器混合云,容器镜像自动同步,资源、应用统一管理运维;单集群超大规模,能潜在需求新客户超大规模数据统计 两个中心诉求;独立解耦,不绑定底层基于设施,广泛全面支持 各类虚拟化方案:VMware、OpenS tack、FusionSphere等;全面支持 独立的租户子系统,并可与新客户租户子系统对接;3种容器必删 方案:Overlay L2,Underlay OVS,Underlay IPVLan,这也方面兼容Calico,全面覆盖各类容器必删 场景;全面的运维体系,监控、日志持久化存储,告警对接每个用户告警子系统(SMTP、SMS),7乘24小时专业及运维全面支持 。
在数据统计 交付阶段,华为云基因测序针对对象方案直接提供快速交付高速通道,简化这也方面操作,安全可靠。华为云直接提供云硬盘(EVS)、弹性文件服务方面 (SFS)和对象存储服务方面 (OBS)等多种类型的云存储服务方面 ,展开多级可靠性架构,无法保证数据统计 持久性我们可以未超过99.9999999999%(12个9),业务已连续性我们可以未超过99.995%,中有对象存储直接提供标准中、低频和归档类型,存储成本最低可达0.033元/GB/月。
已连续的赋能大行业
如上所述,华为云基因测序针对对象方案直接提供了标准中架构与已连续的创新,直接提供标准中的高性能计算架构,能潜在需求本地机房与公有云无缝对接的能潜在需求,这也方面新推出过 键式生信详细分析平台支持再利用快速部署生信流程,整体性 大幅提高测序详细分析效率和整体性 大幅提高综合成本
逐渐被 赋能生信民营企业拓展高附加值业务。中有大数据统计 更加强大方面,展开计算存储分离、内存及分布式缓存、智能调度,大数据统计 性能整体性 大幅提高40%,成本整体性 大幅提高50%;人工智能更加强大方面,展开作业群组管理、拓扑感知的亲和性调度,GPU线性加速比整体性 大幅提高35%,整体性 大幅提高人工智能50%训练时间时;鲲鹏算力,整型计算+多核契合测序详细分析,Minimap2各类软件在鲲鹏920下性价比领先同代x86处理方法器20%。
是是因为这也个的自身实力,华为云逐渐被 赋能大行业。中有武汉我希望组&未来几年组联手华为,整体性 大幅提高基因测序效率。武汉未来几年组一体式Kunlun超大内存裸金属服务方面 器,承载重楼百合150G基因组装;打通线下数据统计 生产平台支持与云端高性能计算平台支持两者之两者之间必删 链路,所以线下由此的数据统计 更多人人更多人人快速上传到云端,由此展开后续的详细分析。数据统计 我们可以未超过云端后,跟据部分项目能潜在需求,在掌控台申请足够规模的弹性云计算资源,快速快速实现部分项目。
在医疗健康大行业同步升级有大背景下,基因测序更多人人更多人人紧密结合更多人的各种技术手段来我们可以未超过更高的精准度和科学性,华为云基因测序针对对象方案释放云+AI+5G的更加强大动能,再利用生信民营企业降本增效,快速实现大行业的智能化同步升级。
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